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細(xì)胞凋亡檢測方法
細(xì)胞凋亡與壞死是兩種*不同的細(xì)胞凋亡形式,根據(jù)死亡細(xì)胞在形態(tài)學(xué)、生物化學(xué)和分子生物學(xué)上的差別,可以將二者區(qū)別開來。細(xì)胞凋亡的檢測方法有很多,下面介紹幾種常用的測定方法。
一、細(xì)胞凋亡的形態(tài)學(xué)檢測
根據(jù)凋亡細(xì)胞固有的形態(tài)特征,人們已經(jīng)設(shè)計(jì)了許多不同的細(xì)胞凋亡形態(tài)學(xué)檢測方法。
1 光學(xué)顯微鏡和倒置顯微鏡
(1) 未染色細(xì)胞:凋亡細(xì)胞的體積變小、變形,細(xì)胞膜完整但出現(xiàn)發(fā)泡現(xiàn)象,細(xì)胞凋亡晚期可見凋亡小體。
貼壁細(xì)胞出現(xiàn)皺縮、變圓、脫落。
(2) 染色細(xì)胞:常用姬姆薩染色、瑞氏染色等。凋亡細(xì)胞的染色質(zhì)濃縮、邊緣化,核膜裂解、染色質(zhì)分割
成塊狀和凋亡小體等典型的凋亡形態(tài)。
2 熒光顯微鏡和共聚焦激光掃描顯微鏡
一般以細(xì)胞核染色質(zhì)的形態(tài)學(xué)改變?yōu)橹笜?biāo)來評判細(xì)胞凋亡的進(jìn)展情況。
常用的DNA特異性染料有:HO 33342 (Hoechst 33342),HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。三種染料與 DNA的結(jié)合是非嵌入式的,主要結(jié)合在DNA的A-T堿基區(qū)。紫外光激發(fā)時(shí)發(fā)射明亮的藍(lán)色熒光。
Hoechst是與DNA特異結(jié)合的活性染料,儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度,使用時(shí)用PBS稀釋成終濃度為2~5mg/ml。
DAPI為半通透性,用于常規(guī)固定細(xì)胞的染色。儲存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度,使用終濃度一般為0.5 ~1mg/ml。
結(jié)果評判:細(xì)胞凋亡過程中細(xì)胞核染色質(zhì)的形態(tài)學(xué)改變分為三期:Ⅰ期的細(xì)胞核呈波紋狀(rippled)或呈折縫樣(creased),部分染色質(zhì)出現(xiàn)濃縮狀態(tài);Ⅱa期細(xì)胞核的染色質(zhì)高度凝聚、邊緣化;Ⅱb期的細(xì)胞核裂解為碎塊,產(chǎn)生凋亡小體(圖1)。
3 透射電子顯微鏡觀察
結(jié)果評判:凋亡細(xì)胞體積變小,細(xì)胞質(zhì)濃縮。凋亡Ⅰ期(pro-apoptosis nuclei)的細(xì)胞核內(nèi)染色質(zhì)高度盤繞,出現(xiàn)許多稱為氣穴現(xiàn)象(cavitations)的空泡結(jié)構(gòu)(圖2);Ⅱa期細(xì)胞核的染色質(zhì)高度凝聚、邊緣化;細(xì)胞凋亡的晚期,細(xì)胞核裂解為碎塊,產(chǎn)生凋亡小體。
二、磷脂酰絲氨酸外翻分析(Annexin V法)
磷脂酰絲氨酸(Phosphatidylserine, PS)正常位于細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè),但在細(xì)胞凋亡的早期,PS可從細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè)翻轉(zhuǎn)到細(xì)胞膜的表面,暴露在細(xì)胞外環(huán)境中(圖3)。Annexin-V是一種分子量為35~36KD的Ca2+依賴性磷脂結(jié)合蛋白,能與PS高親和力特異性結(jié)合。將Annexin-V進(jìn)行熒光素(FITC、PE)或biotin標(biāo)記,以標(biāo)記了的Annexin-V作為熒光探針,利用流式細(xì)胞儀或熒光顯微鏡可檢測細(xì)胞凋亡的發(fā)生。
碘化丙啶(propidine iodide, PI)是一種核酸染料,它不能透過完整的細(xì)胞膜,但在凋亡中晚期的細(xì)胞和死細(xì)胞,PI能夠透過細(xì)胞膜而使細(xì)胞核紅染。因此將Annexin-V與PI匹配使用,就可以將凋亡早晚期的細(xì)胞以及死細(xì)胞區(qū)分開來。
方法
1 懸浮細(xì)胞的染色:將正常培養(yǎng)和誘導(dǎo)凋亡的懸浮細(xì)胞(0.5~1×106)用PBS洗2次,加入100ul Binding Buffer和FITC標(biāo)記的Annexin-V(20ug/ml)10ul,室溫避光30min,再加入PI(50ug/ml)5ul,避光反應(yīng)5min后,加入400ul Binding Buffer,立即用FACScan進(jìn)行流式細(xì)胞術(shù)定量檢測(一般不超過1h), 同時(shí)以不加AnnexinV-FITC及PI的一管作為陰性對照。
2 貼壁培養(yǎng)的細(xì)胞染色:先用0.25%的胰酶消化,洗滌、染色和分析同懸浮細(xì)胞。
3 爬片細(xì)胞染色:同上,zui后用熒光顯微鏡和共聚焦激光掃描顯微鏡進(jìn)行觀察。
注意事項(xiàng)
1. 整個(gè)操作動(dòng)作要盡量輕柔,勿用力吹打細(xì)胞。
2. 操作時(shí)注意避光,反應(yīng)完畢后盡快在一小時(shí)內(nèi)檢測。
三、線粒體膜勢能的檢測
線粒體在細(xì)胞凋亡的過程中起著樞紐作用,多種細(xì)胞凋亡刺激因子均可誘導(dǎo)不同的細(xì)胞發(fā)生凋亡,而線粒體跨膜電位的下降,被認(rèn)為是細(xì)胞凋亡級聯(lián)反應(yīng)過程中zui早發(fā)生的事件,它發(fā)生在細(xì)胞核凋亡特征(染色質(zhì)濃縮、DNA斷裂)出現(xiàn)之前,一旦線粒體DYmt崩潰,則細(xì)胞凋亡不可逆轉(zhuǎn)。
線粒體跨膜電位的存在,使一些親脂性陽離子熒光染料如Rhodamine 123、3,3-Dihexyloxacarbocyanine iodide[DiOC6(3)]、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide[JC-1]、Tetramethyl rhodamine methyl ester(TMRM)等可結(jié)合到線粒體基質(zhì),其熒光的增強(qiáng)或減弱說明線粒體內(nèi)膜電負(fù)性的增高或降低。
方法:將正常培養(yǎng)的細(xì)胞和誘導(dǎo)凋亡的細(xì)胞加入使用終濃度為Rhodamine 123(1mM)或終濃度為DiOC6(25nM),JC-1(1mM),TMRM(100nM),37°C平衡30min,流式細(xì)胞計(jì)檢測細(xì)胞的熒光強(qiáng)度。
注意事項(xiàng)
1. 始終保持平衡染液中pH值的一致性,因?yàn)閜H值的變化將影響膜電位。
2. 與染料達(dá)到平衡的細(xì)胞懸液中如果含有蛋白,他們將與部分染料結(jié)合,降低染料的濃度,引起假去極化。
四、DNA檢測
細(xì)胞凋亡時(shí)主要的生化特征是其染色質(zhì)發(fā)生濃縮, 染色質(zhì)DNA在核小體單位之間的連接處斷裂, 形成50~300kbp長的DNA大片段, 或180~200bp整數(shù)倍的寡核苷酸片段, 在凝膠電泳上表現(xiàn)為梯形電泳圖譜(DNA ladder)。細(xì)胞經(jīng)處理后,采用常規(guī)方法分離提純DNA,進(jìn)行瓊脂糖凝膠和溴化乙啶染色,在凋亡細(xì)胞群中可觀察到典型的DNA ladder。如果細(xì)胞量很少,還可在分離提純DNA后,用32P-ATP和脫氧核糖核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶(TdT)使DNA標(biāo)記,然后進(jìn)行電泳和放射自顯影,觀察凋亡細(xì)胞中DNA ladder的形成。
1. 大分子染色體DNA測定
細(xì)胞凋亡的早期,染色體斷裂成為50~300kbp長的DNA大片段。所有超過一定分子量大小的雙鏈DNA分子在瓊脂糖凝膠中的遷移速度相同。線性DNA的雙螺旋半徑超過凝膠半徑時(shí),即達(dá)到分辨力的極限。此時(shí)凝膠不再按分子量的大小來篩分DNA,DNA像通過彎管一樣,以其一端指向電場一極而通過凝膠,這種遷移模式稱之為"爬行"。因此,細(xì)胞凋亡早期產(chǎn)生的50~300kbp長的DNA大片段不能用普通的瓊脂糖凝膠電泳來分離。通常采用脈沖電泳技術(shù)可圓滿地解決這一問題。這個(gè)方法是在凝膠上外加正交的交變脈沖電場。每當(dāng)電場方向改變后,大的DNA分子便滯流在爬行管中,直至新的電場軸向重新定向后,才能繼續(xù)向前移動(dòng)。DNA分子量越大,這種重排所需要的時(shí)間就越長。當(dāng)DNA分子變換方向的時(shí)間小于電脈沖周期時(shí),DNA就可以按其分子量大小分開。
參考文獻(xiàn) Brown,D.G., Sun, X.M., and Cohen, G.M.(1993) Dexamethasone-induced apoptosis involves cleavage of DNA to large fragments prior to internucleosomal fragmentation. J. Biol.Chem. 268, 3037-3039
2. DNA Ladder 測定
方法:收獲細(xì)胞(1X107)沉淀?細(xì)胞裂解液?13000rpm′5min, 收集上清?1%SDS和RnaseA(5mg/ml)56°C,
2h?蛋白酶K(2.5mg/ml)37°C,2h?1/10體積3M醋酸鈉和2.5倍體積的冷無水乙醇沉淀DNA,4°C一夜?14000rpm′15min?zui后將沉淀溶解在TE buffer中,加DNA Loading Buffer?1.2%瓊脂糖凝膠電泳,EB染色并照相。
3. 凋亡細(xì)胞DNA含量的流式細(xì)胞計(jì)分析
方法:收集細(xì)胞,70%冷乙醇(in PBS)4°C固定置夜,PBS洗滌,1000rpm′10min RNase A(0.5mg/ml)37°C消化30min PI(50mg/ml)染色,室溫避光15min,F(xiàn)ACScan分析DNA亞二倍體的形成及細(xì)胞周期的變化。
4. ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay (CLONTECH)
優(yōu)點(diǎn):敏感度高,適合于檢測少量樣本,小部分凋亡細(xì)胞。如臨床活組織檢測。
五 TUNEL法
細(xì)胞凋亡中, 染色體DNA雙鏈斷裂或單鏈斷裂而產(chǎn)生大量的粘性3'-OH末端,可在脫氧核糖核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶(TdT)的作用下,將脫氧核糖核苷酸和熒光素、過氧化物酶、堿性磷酸酶或生物素形成的衍生物標(biāo)記到DNA的3'-末端,從而可進(jìn)行凋亡細(xì)胞的檢測,這類方法稱為脫氧核糖核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo)的缺口末端標(biāo)記法(terminal -deoxynucleotidyl transferase mediated nick end labeling, TUNEL)。由于正常的或正在增殖的細(xì)胞幾乎沒有DNA的斷裂,因而沒有3'-OH形成,很少能夠被染色。TUNEL實(shí)際上是分子生物學(xué)與形態(tài)學(xué)相結(jié)合的研究方法,對完整的單個(gè)凋亡細(xì)胞核或凋亡小體進(jìn)行原位染色,能準(zhǔn)確地反應(yīng)細(xì)胞凋亡典型的生物化學(xué)和形態(tài)特征,可用于石蠟包埋組織切片、冰凍組織切片、培養(yǎng)的細(xì)胞和從組織中分離的細(xì)胞的細(xì)胞形態(tài)測定,并可檢測出極少量的凋亡細(xì)胞,因而在細(xì)胞凋亡的研究中被廣泛采用。
六、Caspase-3活性的檢測
Caspase家族在介導(dǎo)細(xì)胞凋亡的過程中起著非常重要的作用,其中caspase-3為關(guān)鍵的執(zhí)行分子,它在凋亡信號傳導(dǎo)的許多途徑中發(fā)揮功能。Caspase-3正常以酶原(32KD)的形式存在于胞漿中,在凋亡的早期階段,它被激活,活化的Caspase-3由兩個(gè)大亞基(17KD)和兩個(gè)小亞基(12KD)組成,裂解相應(yīng)的胞漿胞核底物,zui終導(dǎo)致細(xì)胞凋亡。但在細(xì)胞凋亡的晚期和死亡細(xì)胞,caspase-3的活性明顯下降。
1 Western blot 分析Procaspase-3的活化,以及活化的Caspase-3及對底物多聚(ADP-核糖)聚合酶[poly(ADP-ribose)polymerase,PARP]等的裂解。
方法:
收集細(xì)胞→PBS洗滌→抽提細(xì)胞裂解液→蛋白定量→SDS-PAGE電泳→硝酸纖維素膜或PVDF膜轉(zhuǎn)移→5%脫脂奶粉封閉,室溫1.5~2h或4°C置夜→Caspase-3多抗或單抗室溫反應(yīng)1~2h或4°C置夜→TBS-T(含0.05% Tween 20的TBS)洗3次,5~10min/次→HRP-標(biāo)記的羊抗鼠IgG或AP標(biāo)記的羊抗鼠IgG室溫反應(yīng)1~2h→ TBS-T洗3次, 5~10min/次?→ECL顯影或NBT/BCIP顯色。
2 熒光分光光度計(jì)分析
原理:活化的Caspase-3能夠特異切割D1E2V3D4-X底物,水解D4-X肽鍵。根據(jù)這一特點(diǎn),設(shè)計(jì)出熒光物質(zhì)偶聯(lián)的短肽Ac-DEVD-AMC。在共價(jià)偶聯(lián)時(shí),AMC不能被激發(fā)熒光,短肽被水解后釋放出AMC,自由的AMC才能被激發(fā)發(fā)射熒光。根據(jù)釋放的AMC熒光強(qiáng)度的大小,可以測定caspase-3的活性,從而反映Caspase-3被活化的程度。
方法:收獲細(xì)胞正?;虻蛲黾?xì)胞,PBS洗滌,制備細(xì)胞裂解液加Ac-DEVD-AMC(caspase-3四肽熒光底物)?37°C反應(yīng)1h,熒光分光光度計(jì)(Polarstar)分析熒光強(qiáng)度(激發(fā)光波長380nm,發(fā)射光波長為430-460nm)。
3 流式細(xì)胞術(shù)分析
方法:收獲細(xì)胞正?;虻蛲黾?xì)胞?PBS洗滌,加Ac-DEVD-AMC 37°C反應(yīng)1h UV流式細(xì)胞計(jì)分析caspase-3陽性細(xì)胞數(shù)和平均熒光強(qiáng)度。
七、凋亡相關(guān)蛋白TFAR19蛋白的表達(dá)和細(xì)胞定位分析
TFAR19(PDCD5)是由本研究室在上首先報(bào)導(dǎo)的一個(gè)擁有自己知識產(chǎn)權(quán)的人類新基因,前期的功能研究表明,它是促進(jìn)細(xì)胞凋亡的增強(qiáng)劑。利用熒光素(FITC)標(biāo)記的TFAR19單克隆抗體為探針,對細(xì)胞凋亡過程中TFAR19蛋白的表達(dá)水平及定位研究發(fā)現(xiàn),凋亡早期TFAR19表達(dá)水平增高并出現(xiàn)快速核轉(zhuǎn)位現(xiàn)象,伴隨著細(xì)胞核形態(tài)學(xué)的變化,持續(xù)較長時(shí)間,在凋亡小體中仍然可見。同時(shí)我們發(fā)現(xiàn),凋亡早期TFAR19蛋白的核轉(zhuǎn)位早于磷脂酰絲氨酸(PS)外翻和細(xì)胞核DNA的片段化,提示TFAR19蛋白的核轉(zhuǎn)位是細(xì)胞凋亡更早期發(fā)生的事件之一。進(jìn)一步的研究證明,凋亡早期TFAR19的核轉(zhuǎn)位具有普遍意義,不同細(xì)胞凋亡早期均出現(xiàn)TFAR19高表達(dá)和核轉(zhuǎn)位。這為研究細(xì)胞凋亡早期所發(fā)生的事件,提供了一種新的技術(shù)和指標(biāo)。
(一)TFAR19蛋白的細(xì)胞定位分析
材料試劑:
FITC標(biāo)記的單克隆抗體,pH7.4 、0.15Mol/L PBS,3%的多聚甲醛,PBS-T(pH7.4 、0.15Mol/L PBS 含0.2% Tween 20),胎牛血清,熒光細(xì)胞洗液:pH7.4 、0.15Mol/L PBS含2%胎牛血清及0.1%NaN3 。FACS管,Tip頭,移液器。
儀器:低溫水平離心機(jī), 37°C水浴箱,熒光顯微鏡,共聚焦激光掃描顯微鏡,流式細(xì)胞計(jì)
方法:
1 懸浮細(xì)胞的染色:
(1)收獲正常和誘導(dǎo)凋亡的細(xì)胞(0.5~1′106),PBS洗2次,1000rpm′10min。
(2)3%多聚甲醛冰浴10min,PBS洗2次,1000rpm′10min。
(3)加入PBS-T溶液,37°C孵育15min,PBS洗2次,1000rpm′10min。
(4)加入200ml胎牛血清,室溫反應(yīng)30min。
(5)加入5ml FITC標(biāo)記的TFAR19單抗(終濃度為1:40),4°C反應(yīng)30min
(6)熒光細(xì)胞洗液洗2次,1000rpm 10min。
結(jié)果觀察:將細(xì)胞沉淀滴片,熒光顯微鏡及共聚焦激光顯微鏡下觀察TFAR19在細(xì)胞中的定位。同時(shí)用流式細(xì)胞計(jì)定量檢測TFAR19蛋白的平均熒光強(qiáng)度。
2:貼壁細(xì)胞的原位染色
(1) 貼壁生長的對數(shù)期細(xì)胞鋪在24孔或6孔板中(內(nèi)有潔凈蓋玻片),讓其爬片生長,待長到
50%~80%滿時(shí),凋亡誘導(dǎo)劑處理細(xì)胞。
(2) 將不同時(shí)間點(diǎn)處理的細(xì)胞進(jìn)行免疫熒光染色,染色步驟同上。
(3) 將染色的爬片細(xì)胞放于一張滴有少量甘油(5ml)的載玻片上,熒光顯微鏡或共聚焦激光掃描顯微鏡觀察TFAR19在細(xì)胞中的定位。
3:臨床病理切片的染色、檢測。
4:原代細(xì)胞的培養(yǎng)、檢測。
5:分析TFAR19蛋白在人體內(nèi)各組織器官的分布及定位
(二)TFAR19蛋白的表達(dá)與臨床疾病
1. ELISA法檢測正常人和疾病狀態(tài)下,以及疾病的不同時(shí)期,血清中TFAR19蛋白水平及其TFAR19自身抗體水平。
材料和試劑:
1. 包被Buffer: pH9.6, 0.05Mol/L碳酸鹽Buffer
2. 洗滌液: pH7.4, 0.15Mol/L PBS 含0.05% Tween 20
3. 封閉液: 3%BSA(用洗滌液配制)
4. 酶標(biāo)抗體的稀釋:用封閉液稀釋
5. OPD底物Buffer:Na2HPO4.12H2O 1.84g
檸檬酸 0.51g
DDW 100ml
6. 顯色液(現(xiàn)配現(xiàn)用):底物Buffer 10ml
OPD 2mg
30% H2O2 2ml
7. 終止液 2Mol/L H2SO48. 重組人TFAR19, HRP標(biāo)記的羊抗人IgG9. ELISA板, Tip, 移液器,ELISA
Reader(OD490nm),洗板機(jī)
操作步驟
1. 用包被Buffer稀釋的重組人TFAR19(1mg/ml)包被ELISA板, 100ml/well, 37°C孵育2h或4°C置夜(一般24h以上)。
2. 洗滌Buffer洗板三次,加入封閉液,200 ml/well , 37°C孵育2h或4°C
置夜。
3. 洗滌Buffer洗板三次,加入不同稀釋度的病人血清(3個(gè)重復(fù)孔)100ml/well ,37°C孵育1h。設(shè)包被Buffer、洗滌Buffer 、封閉液為陰性對照。
4. 洗滌Buffer洗板三次,加入1:2500稀釋的HRP標(biāo)記的抗人IgG, 100ml/well,37°C孵育1h。
5. 洗滌Buffer洗板三次,加入顯色液,100 ml/well,避光反應(yīng)10~15min。
6. 加入H2SO4終止反應(yīng),50 ml/well。
7. ELISA Reader 讀取OD490 光密度值,分析和比較病人血清和正常血 清中TFAR19自身抗體的表達(dá)水平。
8. Western blot 分析原發(fā)性腫瘤細(xì)胞和正常細(xì)胞的TFAR19蛋白的表達(dá)水平。
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